Конференции в центре обычно посвящены обсуждению новых результатов, методов, подходов в области математических наук.
Организаторами конференции выступают совместно центр и группа исследователей, чья заявка была поддержана Научным советом центра. Организаторы могут привлекать финансовую поддержку иных организаций, в этом случае они также считаются организаторами.

Конференция длится 5 дней с понедельника по пятницу, участники обычно прибывают в воскресенье и уезжают в пятницу вечером или в субботу. Программа мероприятия составляется внешними организаторами; желающие принять участие в конференции с докладом должны обращаться к ним. Тем не менее, посещение всех лекций и дискуссий свободное.

Во время конференции центр предоставляет:

Конференц-зал, а при необходимости еще 1-2 комнаты для групповой работы и дискуссий, оборудованные досками, проекторами и экранами.
Проезд (экономическим классом) и проживание, включая 2-разовое питание, для не более, чем 40 участников, рекомендованных организаторами. Бюджет центра позволяет оплатить лишь ограниченное количество трансконтинентальных перелетов.
1-2 кофе-паузы в рабочие дни конференции, а также приветственный фуршет для всех участников.
Визовую поддержку всем иностранным участникам.

Организаторам конференции предлагается включить в программу 1 или 2 обзорные лекции по теме мероприятия, предназначенных для математической общественности, а также, по согласованию, прочитать научно-популярную лекцию или принять участие в неформальной встрече с учениками и студентами образовательных учреждений ИНТЦ «Сириус».

Центр может пригласить до 20 студентов и аспирантов российских образовательных и научных учреждений для участия в конференции в качестве слушателей. Отбор участников проводится при участии организаторов по резюме и рекомендательным/мотивационным письмам кандидатов.